1. 与CMU合作，引进CMU软件工程类课程。12月18日，南开大学、武汉大学、四川大学、东北大学、西北工业大学，与CMU签订合作协议，引进CMU的10门软件工程类课程。其前，10月在西安进行了第一批师资培训。这是南开大学软件学院在办学国际化进程中跨出的一大步。
2. 软件学院与北京博创科技有限公司合作建立嵌入式系统实验室，共同建设嵌入式系统课程。2004年上半年，博创公司高级技术人员为软件工程硕士开设了“嵌入式系统”课程，“南开大学博创嵌入式系统实验室”于6月26日正式挂牌，南开大学副校长耿运琪教授、八六三计划机器人主题专家组组长王田苗教授共同为实验室揭牌。
3．在南开大学建校八十五周年之际，与我院合作密切的南开创元信息技术有限公司捐资百万，资助软件学院的建设。我院与南开创元信息有限公司的合作进一步扩大、深化。
4. 与国家计算机病毒应急处理中心合作，邀请Russian专家讲授病毒防范技术。9月持续四天的技术讲座在南开大学举办，来自天津市部分高校的师生、国家计算机病毒应急处理中心的技术人员，以及部分企业公司技术人员参加了讲座。 该项活动得到国家外国专家局的资助。
5. 牵手BlackBorad，推动教育教学信息化. 2月27日，软件学院与全球最大的网络教学平台提供商BlackBoard公司签订合作协议，共同推进教育教学软件技术的研究开发、网络教学的推广应用。双方合作建立教育软件技术联合实验室；BlackBorad公司在软件学院设立奖教金，用以奖励学院在开发、应用网络教学工作中表现突出的教师、教学管理人员。
6. 加强与微软亚洲研究院、微软亚洲工程院的合作。校庆前夕，微软亚洲研究院院长特别助理李世鹏博士一行访问我院，就双方的合作进行交流、探讨，微软亚洲研究院网络搜索与挖掘组研究员李航博士应聘为我院兼职教授。此前，我院两位青年教师林晓民、谢茂强得到微软精品课程项目资助。
7. 4月，在IBM教育部大学合作年会上，我校获得2003年度“最佳合作院校”奖。我院2001级本科生孙扬同学获得2004年“IBM优秀学生奖学金”，青年教师殷爱茹老师获得2004年度“IBM奖教金”。
8. 我院与南开创元、津科电子、南开太阳、天津软件测评中心合作建立软件人才培养示范基地与实习基地。该项工作得到天津市科委、天津市教委的支持。
9. 我院与解放军总后勤部在人才培养上进行合作，开辟人才培养的新天地。
